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Tomado de Design Patterns for e-Science, Henry Gardner and Gabriele Manduchi
Supercomputación


• Es lo mas grande y rápido en computación
  en este preciso momento.
• Es también la computadora mas grande y
  rápida del mundo es este instante.
• Hay una regla?, un supercomputador es
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Otras formas...

La supercomputación también se
  conoce como:

– Computación de Alto Rendimiento
– High Performance Computing
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– Ciberinfraestructura -
  Cyberinfrastructure (CI).
Tipos
Computadora Paralela: Máquina con dos o más
procesadores que pueden trabajar simultánea y/o
coordinadamente.

Memoria Compartida: En una máquina paralela existe una
sola memoria que puede ser accedida por todos los
procesadores.

Memoria Distribuida: Cada uno de los procesadores de un
multiprocesador tiene asociado a él una unidad de memoria.
Usos


Simulación de fenómenos físicos,
tales como:
    – Pronóstico del tiempo
    – Formación de Galaxias
    – Administración de las
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Minería de datos



– Secuenciación de genes
– Procesamiento de señales
– Detección de las tormentas que pueden producir
  tornados
Ejemplo

En el laboratorio Argonne el supercomputador Blue Gene/P permite ver la
simulación de la explosión de una estrella supernova, este proceso en un PC
tardaría 22 millones de horas el evento tarda solo 5 segundos.


Este supercomputador tiene mas de 160.000 procesadores
Características GRID
Necesidad

• Procesamiento de datos con altos volúmenes de
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Necesidad



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Proceso pequeño 2
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Necesidad

• Suma de 1 a 100... Como?

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Por GRID
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Solución por Hardware

1)
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  through open distributed computing. The OSG is a
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regional, community and national cyberinfrastructures
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Grid Colombia

Grid Colombia es una organización en formación, con
 una base fundamentalmente académica, destinada
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 puesta en operación del primer grid de cómputo de
  alcance nacional que facilite el establecimiento y
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Computación en GRID
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Supercomputación y GRID para eScience

  • 1. Laboratorio de computación de alto desempeño, HPCLAB – GRID Colombia
  • 2. eScience: Ciencias Computacionales y Tecnologías de la información al servicio de la Ciencia Tomado de Design Patterns for e-Science, Henry Gardner and Gabriele Manduchi
  • 3.
  • 4. Supercomputación • Es lo mas grande y rápido en computación en este preciso momento. • Es también la computadora mas grande y rápida del mundo es este instante. • Hay una regla?, un supercomputador es mínimo 100 veces mas rápido que el PC mas rápido del mundo
  • 5. Otras formas... La supercomputación también se conoce como: – Computación de Alto Rendimiento – High Performance Computing (HPC). – High End Computing (HEC). – Ciberinfraestructura - Cyberinfrastructure (CI).
  • 6. Tipos Computadora Paralela: Máquina con dos o más procesadores que pueden trabajar simultánea y/o coordinadamente. Memoria Compartida: En una máquina paralela existe una sola memoria que puede ser accedida por todos los procesadores. Memoria Distribuida: Cada uno de los procesadores de un multiprocesador tiene asociado a él una unidad de memoria.
  • 7. Usos Simulación de fenómenos físicos, tales como: – Pronóstico del tiempo – Formación de Galaxias – Administración de las reservas de petróleo
  • 8. Minería de datos – Secuenciación de genes – Procesamiento de señales – Detección de las tormentas que pueden producir tornados
  • 9. Ejemplo En el laboratorio Argonne el supercomputador Blue Gene/P permite ver la simulación de la explosión de una estrella supernova, este proceso en un PC tardaría 22 millones de horas el evento tarda solo 5 segundos. Este supercomputador tiene mas de 160.000 procesadores
  • 11. Necesidad • Procesamiento de datos con altos volúmenes de operaciones matemáticas y manejo de datos
  • 12. Necesidad Proceso • grande
  • 13. Necesidad ¡Divide y vencerás! Proceso pequeño 1 Proceso pequeño 2 ... Proceso pequeño N
  • 14. Necesidad • Suma de 1 a 100... Como? • Tradicional... 1+2+3+...100
  • 15. Necesidad Por GRID • P1 = 1+2+3+...10 • P2 = 11+12+...20 •… • Ptotal = P1+P2+...Pn
  • 16. Solución por Hardware 1) 2)Super computador con muchos núcleos 3) 4)Clusterización de N maquinas 5) 6)Contrucción de un GRID
  • 17. Solución Software • Python, Fortran, Ruby, Java, C, C++... • Octave, Blender, Ocean...
  • 18. Esquema actual SPIDER • Frontend • Computer Element • N Worker Nodes fijos • N Worker Nodes oportunistas GRID COLOMBIA • Conexión a GRID Colombia
  • 19. Esquema actual SPIDER • Frontend – 2 Núcleos • Computer Element – 2 Núcleos • N Worker Nodes fijos – 42 Nucleos • N Worker Nodes oportunistas – 100+ Núcleos GRID COLOMBIA • Conexión a GRID Colombia – N Núcleos
  • 20. Open Science Grid The Open Science Grid (OSG) advances science through open distributed computing. The OSG is a multi-disciplinary partnership to federate local, regional, community and national cyberinfrastructures to meet the needs of research and academic communities at all scales.
  • 21.
  • 22. Grid Colombia Grid Colombia es una organización en formación, con una base fundamentalmente académica, destinada originalmente a centralizar los esfuerzos para la puesta en operación del primer grid de cómputo de alcance nacional que facilite el establecimiento y desarrollo de la e-ciencia en Colombia usando las Redes de Tecnología Avanzada (RENATA) a escala regional y nacional.
  • 24. Recursos y posibilidades • Poder de cómputo • Almacenamiento • Comunicaciones • Software y Licencias de Software • Equipamientos y recursos especiales • Trabajos y Aplicaciones • Planificación, reserva y liberación de recursos
  • 25.
  • 28. Laboratorio de computación de alto desempeño de la UTB http://hpclab.unitecnologica.edu.co/
  • 29. MISIÓN • Ofrecer una alta capacidad de cómputo a la comunidad cientfica local y regional como herramienta fundamental para el desarrollo de investigación básica y aplicada; generando, apropiando y difundiendo conocimiento en el área de computación de alto desempeño, aplicado al análisis y solución de problemas en ciencias e ingeniería en el ámbito local aportando así al desarrollo de nuestra región.
  • 31.
  • 32. ¿Dudas? http://hpclab.unitecnologica.edu.co http://www.gridcolombia.org https://www.opensciencegrid.org